Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CCDC88CQ9P219 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CCDC88CQ9P219 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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CCDC88CQ9P219 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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CCDC88CQ9P219 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CCDC88CQ9P219 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CCDC88CQ9P219 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CCDC88CQ9P219 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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CCDC88CQ9P219 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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CCDC88CQ9P219 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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