Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms