Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms