Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms