Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DDI1Q8WTU0 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDI1Q8WTU0 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDI1Q8WTU0 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DDI1Q8WTU0 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDI1Q8WTU0 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDI1Q8WTU0 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDI1Q8WTU0 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDI1Q8WTU0 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDI1Q8WTU0 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDI1Q8WTU0 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DDI1Q8WTU0 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDI1Q8WTU0 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDI1Q8WTU0 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDI1Q8WTU0 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDI1Q8WTU0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDI1Q8WTU0 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDI1Q8WTU0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDI1Q8WTU0 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDI1Q8WTU0 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDI1Q8WTU0 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDI1Q8WTU0 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDI1Q8WTU0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDI1Q8WTU0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms