Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LMNTD2Q8IXW0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms