Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP31Q70CQ4 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP31Q70CQ4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms