Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 AC105446.1-201ENST00000441882 407 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 BRCA1-225ENST00000586385 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 AP003306.2-201ENST00000400902 485 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 PIMREG-209ENST00000576056 833 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 AC147067.2-201ENST00000608161 289 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 RBP1-201ENST00000232219 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 RBP1-206ENST00000617459 667 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP350Q5VT06 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AL161644.1-201ENST00000426901 1111 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 MOG-229ENST00000483013 279 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 MOG-232ENST00000490427 327 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 ZNF415-221ENST00000600574 563 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SSR3-202ENST00000463503 596 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC010601.1-201ENST00000569048 446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms