Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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