Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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CNGA3Q16281 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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CNGA3Q16281 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNGA3Q16281 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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CNGA3Q16281 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNGA3Q16281 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNGA3Q16281 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNGA3Q16281 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNGA3Q16281 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNGA3Q16281 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNGA3Q16281 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNGA3Q16281 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CNGA3Q16281 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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CNGA3Q16281 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNGA3Q16281 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNGA3Q16281 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNGA3Q16281 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNGA3Q16281 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNGA3Q16281 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNGA3Q16281 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNGA3Q16281 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CNGA3Q16281 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNGA3Q16281 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CNGA3Q16281 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
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CNGA3Q16281 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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CNGA3Q16281 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNGA3Q16281 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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CNGA3Q16281 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNGA3Q16281 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CNGA3Q16281 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CNGA3Q16281 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNGA3Q16281 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNGA3Q16281 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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CNGA3Q16281 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNGA3Q16281 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CNGA3Q16281 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CNGA3Q16281 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CNGA3Q16281 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CNGA3Q16281 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CNGA3Q16281 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CNGA3Q16281 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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