Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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NCOA1Q15788 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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NCOA1Q15788 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NCOA1Q15788 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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NCOA1Q15788 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NCOA1Q15788 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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