Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SSPNQ14714 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SSPNQ14714 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SSPNQ14714 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SSPNQ14714 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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