Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms