Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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