Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC003101.3-201ENST00000624452 768 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 RNF212B-203ENST00000430154 903 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 POLR3KP1-201ENST00000449146 342 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CAPN3-219ENST00000569136 1029 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 NARF-IT1-201ENST00000584012 769 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC079779.3-201ENST00000588842 1200 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms