Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms