Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU5F1Q01860 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms