Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ME1P48163 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ME1P48163 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms