Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP2K4P45985 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms