Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPD2P43304 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPD2P43304 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPD2P43304 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPD2P43304 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPD2P43304 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPD2P43304 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPD2P43304 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms