Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA2P42262 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 240.2 ms