Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms