Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms