Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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