Protein–RNA interactions for Protein: C9J2C7

NT5C1B-RDH14, NT5C1B-RDH14 readthrough (Fragment), humanhuman

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Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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