Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms