Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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FOXP3Q9BZS1 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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