Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms