Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms