Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms