Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms