Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NKPD1Q17RQ9 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms