Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms