Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms