Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PCM1Q15154 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms