Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TROQ12816 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TROQ12816 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TROQ12816 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TROQ12816 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TROQ12816 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TROQ12816 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TROQ12816 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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