Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms