Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms