Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RWDD2BP57060 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms