Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms