Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NESP48681 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NESP48681 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NESP48681 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NESP48681 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NESP48681 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NESP48681 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NESP48681 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NESP48681 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NESP48681 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NESP48681 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NESP48681 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NESP48681 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NESP48681 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NESP48681 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NESP48681 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NESP48681 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NESP48681 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NESP48681 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NESP48681 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NESP48681 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NESP48681 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NESP48681 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NESP48681 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NESP48681 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NESP48681 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NESP48681 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NESP48681 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NESP48681 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NESP48681 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NESP48681 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NESP48681 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NESP48681 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NESP48681 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NESP48681 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NESP48681 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NESP48681 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NESP48681 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NESP48681 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NESP48681 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms