Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTRNP46939 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTRNP46939 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTRNP46939 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTRNP46939 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTRNP46939 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UTRNP46939 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTRNP46939 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTRNP46939 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTRNP46939 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTRNP46939 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTRNP46939 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTRNP46939 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTRNP46939 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTRNP46939 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTRNP46939 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTRNP46939 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UTRNP46939 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTRNP46939 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTRNP46939 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTRNP46939 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTRNP46939 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 MRPL23-203ENST00000397294 551 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 MORN2-205ENST00000410014 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTRNP46939 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms