Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms