Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMO2P25791 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms