Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNA5P22460 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms