Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms