Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODC1P11926 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms