Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOA1P02647 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOA1P02647 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms