Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNAP02545 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNAP02545 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNAP02545 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms