Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARP2O94887 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARP2O94887 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms